纳豆芽孢杆菌是在20世纪中期被发现并分离出来的，属细菌科、芽孢杆菌属, 其原始菌株与枯草芽孢杆菌相同，是枯草芽孢杆菌的一个亚种。但由于其能固态发酵大豆生产纳豆，因此又被俗称为纳豆芽孢杆菌。

CICC近期对中心保藏的4株纳豆芽孢杆菌进行了菌种复核，并对其发酵性能进行了初步研究。4株菌经形态观察、生理生化特征检测、16S rDNA相似性比较以及（G+C）mol%测定，全部鉴定为枯草芽孢杆菌。其中CICC 10261与CICC 10262固态发酵大豆生产出的纳豆较为符合优质纳豆的标准，具备良好发酵性能。