中国工业微生物菌种保藏管理中心
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新闻动态
2022年04月24日|研究动态
atpD基因序列分析应用于双歧杆菌乳亚种鉴定

卫生部于2009年3月在卫监督食便函〔2009〕74号中把动物双歧杆菌(B. animalis)和乳双歧杆菌(B. lactis)分别列入《可用于生产普通食品的菌种名单》和《可用于婴幼儿配方食品中的菌种名单》中。为了保证此类产品的质量及正确标识, 明确工业用微生物菌株的分类地位并快速准确检测其含量显得非常重要。

ATP操纵子共有8个阅读框架, 相对应是一个7.3 kb的DNA片段。在双歧杆菌中ATP操纵子的基因顺序为atpBEFHAGDC, 这与已知的其他细菌ATP操纵子的基因顺序是一致的, ATP操纵子编码F1-F0ATP酶, 它是由两个亚单位组成, 分别是膜外的F1部分和膜内的F0部分, 此酶是双歧杆菌在酸性条件下生长的必要元素, 它能使双歧杆菌适应不同pH的环境。ATP操纵子特别是atpD基因具有很高的稳定性和普遍性, 适合作为种系分类的分子标记。

CICC运用atpD基因序列分析对双歧杆菌乳亚种(Bifidobacterium animalis subsp. lactis)进行了鉴定,比较16S rDNA序列和atpD基因的系统发育分析结果, 两个区段得到具有一致拓扑结构的系统发育树, 但是, 基于同源性高于99.1%的16S rDNA序列分析, 无法将动物双歧乳亚种DSM 10140T和动物双歧动物亚种ATCC 25527T清楚分开, 而动物双歧乳亚种DSM 10140T和动物双歧动物亚种ATCC 25527T的atpD基因序列有28个核苷酸可替代, 碱基差异率达到2.8%, 可以将两者清楚分开。实验结果表明atpD基因相比16S rDNA序列在动物双歧杆菌亚种水平鉴定上有更好的分辨率,对双歧杆菌属内种及亚种水平的鉴定评价进行了有益的探索。

该研究内容相关文章已发表在《微生物学通报》2010年第37卷第3期。


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